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Delphine GIRAUD

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Maître de Conférences – depuis sept. 2026

Physiologie végétale, section CNU 66-68

Université d’Orléans – UFR Sciences et Techniques

 

Docteur en Génétique, Génomique et Bioinformatique

ORCID : https://orcid.org/0000-0002-1563-0123

Google Scholar : https://scholar.google.fr/citations?user=7ZgK7NgAAAAJ&hl=fr

 

Enseignements :

  • Licence Sciences de la Vie : Biologie cellulaire (TD), Biologie végétale (TP), Diversité et évolution (TP), Physiologie végétale (TD), Photosynthèse (TD), Mycorhize (TD, TP), Epigénétique et dynamique des génomes (TD).

  • Master AETPF : Influence de l'environnement sur le développement des plantes (CM, TP), Interactions plantes-bioagresseurs (CM, TD, TP), La génomique au service de la biologie intégrative (CM, TP), Phytosociologie et Phytoécologie (TP), Bio-informatique (TD).

 

Laboratoire de recherche :

Laboratoire Physiologie, Ecologie et Environnement

UMR INRAE 1328 P2E

Equipe ARCHE : https://www.univ-orleans.fr/fr/p2e/equipes/arbres-et-reponses-aux-contraintes-hydriques-et-environnementales

Axe Epigénétique

 

Thématiques de recherche

Mes travaux de recherche s’inscrivent dans le champ de la génomique évolutive et de la biologie des plantes, avec un intérêt particulier pour les mécanismes génétiques et épigénétiques à l’origine de la diversité et de l’adaptation des espèces. Je m’intéresse plus particulièrement à la dynamique des séquences répétées (éléments transposables, éléments viraux endogènes, séquences satellites) et à leur implication dans la structure et le fonctionnement des génomes favorisant la diversification des espèces. Je développe des outils bioinformatiques qui me permettent d’analyser des données omiques issues de différentes plantes pérennes présentant des génomes complexes diploïdes et polyploïdes (peupliers, agrumes, spartines).

 

Expériences professionnelles

2024 – 2025 Post-doctorat INRAE de Corse – UMR AGAP INSTITUT Equipe SEAPAG (Structure évolutive des agrumes, polyploïdie et amélioration génétique) – San Giuliano, Corse. 

Projet IBISA-CRB

Optimisation de la conservation des accessions du CRB Citrus et identification variétale pour la traçabilité et le développement d'une base internationale

 

2025 Vacation d’enseignement Bio-informatique, bio-statistique

Ecole d’ingénieurs PAOLITECH - Université de Corte – 6h TP/TD UE Initiation à la bioinformatique

 

2023 - 2024 Post-doctorat INRAE de Corse – UMR AGAP INSTITUT Equipe SEAPAG – Corse.

Projet Horizon Europe InnoBreed https://innobreed.eu/

Identification de régions génomiques et de marqueurs moléculaires associés à des gènes candidats pour la qualité des fruits d’agrumes par des analyses de génétique d'association

 

2022 - 2023 Chargée d’étude R&D Entreprise Cointreau

https://www.cointreau.com/fr/fr/art-de-cointreau - Saint-Barthélemy-d'Anjou

Développement de marqueurs génétiques pour l’amélioration de la traçabilité des peaux d’oranges importées

 

2020 - 2021 Post-doctorat INRAE de Corse – UMR AGAP INSTITUT Equipe SEAPAG – Corse.

Financement INRAE Département BAP (Biologie et Amélioration des Plantes)

Rôle des éléments transposables dans la variabilité phénotypique des agrumes propagés végétativement

 

2016 - 2019 Doctorat Laboratoire ECOBIO - UMR-CNRS 6553 ECOBIO Equipe EGA (Evolution, Génomes, Adaptation) - Université de Rennes 1. 

Dynamique des éléments transposables et évolution du génome des Spartines polyploïdes

Etude de la dynamique évolutive des séquences répétées au sein du genre Spartina

Etude de l’évolution de l’expression des gènes et des ETs suite aux hybridations et allopolypoïdisation

Etude de l’évolution de la régulation des gènes et des ETs suite à la spéciation allopolyploïde récente

 

2016 - 2019 Vacations d’enseignement Bio-informatique, bio-statistique & Biologie végétale

Université de Rennes 1 – 3 x 64h TP/TD

 

2017 Scientifique invité – Iowa State University, Department of Ecology, Evolution and Organismal Biology - USA. 

Collaboration franco-américaine dans le cadre du LIA Ecological Genomics of polyploid

 

2016 Stage Laboratoire ECOBIO - UMR-CNRS 6553 ECOBIO Equipe EGA - Rennes. 

Stage de 6 mois dans le cadre du Master 2 Bio-informatique et génomique

Hybridation interspécifique, polyploïdie : évolution de l’expression des gènes chez les Spartines

 

2015 Stage Laboratoire ECOBIO - UMR-CNRS 6553 ECOBIO Equipe EGA - Rennes. 

Stage de 8 semaines dans le cadre du Master 1 Bio-informatique et génomique

Détection de copies dupliquées chez les Spartines polyploïdes à partir de données NGS et de l’outil de détection d’haplotypes « IlluHaplotyper »

 

2014 Stage Centre INRA de Tours - UMR Physiologie de la Reproduction et des Comportements - Nouzilly

Stage de 8 semaines dans le cadre de la Licence Sciences du Vivant

Construction de plasmides pour la mise en évidence de l’interaction de 2 protéines par microscopie BiFC

 

Formation

2016 - 2019 : Doctorat de Génétique, génomique et bio-informatique - Université de Rennes 1

Bourse ministérielle MESR 2016-2019 – UMR-CNRS 6553 ECOBIO

2014 - 2016 : Master Bio-Informatique et génomique - Université de Rennes 1

2011 - 2014 : Licence Sciences du Vivant - Université de La Rochelle

 

Publications :

Google Scholar : https://scholar.google.fr/citations?user=7ZgK7NgAAAAJ&hl=fr