Soutenance de thèse de Yiyi TAN

Les arbres, en tant que plantes pérennes typiques, présentent une croissance radiale de leur tronc assurée par l’activité continue d’un méristème secondaire, le cambium vasculaire. Chez les angiospermes, les cellules du cambium se différencient vers l’intérieur en fibres, en éléments de vaisseaux et en cellules parenchymateuses des rayons, assumant respectivement des fonctions essentielles de soutien, de conduction de la sève et de stockage des nutriments. Les mécanismes moléculaires contrôlant la formation du bois constituent depuis longtemps un thème central de la biologie végétale. Cependant, en raison de la complexité structurelle du bois et des différences marquées entre types cellulaires — en termes de trajectoires développementales, de composition pariétale et de fonctions —, l’étude de ces mécanismes demeure un défi majeur. Cette étude vise à explorer, à l’échelle cellulaire, les mécanismes moléculaires dynamiques impliqués dans la formation de la paroi secondaire des fibres ligneuses. Pour ce faire, nous avons combiné l’imagerie hyper-spectrale ATR-FTIR et le séquençage d’ARN à noyau unique (snRNA-seq) : la première permet une caractérisation fine de la composition chimique des parois cellulaires selon les conditions et les types cellulaires, tandis que la seconde offre une résolution transcriptionnelle au niveau du noyau pour les fibres à différents stades de développement. En intégrant les données phénotypiques des parois cellulaires avec les profils transcriptomiques, nous avons identifié plusieurs facteurs régulateurs clés associés au développement des fibres et à la dynamique de certaines composantes pariétales. Ce travail constitue la première intégration, à l’échelle du noyau unique, des données transcriptomiques et spectroscopiques infrarouges, fournissant de nouveaux gènes candidats et un cadre d’analyse pour l’étude des régulations spécifiques aux différents types cellulaires au cours de la formation du bois.